Scientific Reports volume 13、記事番号: 10958 (2023) この記事を引用
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抗レトロウイルス併用療法 (cART) の出現は、HIV-1 の複製と感染を制御し、関連する罹患率と死亡率を減少させるのに役立ちました。 しかし、cART 単独では HIV-1 を治癒することはできません。これは、cART が中断されると再び血漿ウイルス血症を引き起こす、長命で潜伏感染した免疫細胞が存在するためです。 再活性化された HIV の多様性、ウイルス増殖、および複製ダイナミクスをさらに理解するための ex vivo 培養法を使用した HIV 治癒戦略の評価は、エンドポイント検出の感度を高めるために単一分子アレイ (Simoa) テクノロジーに基づく超高感度デジタル ELISA を使用して強化されます。 。 ウイルス増殖アッセイ (VOA) では、指数関数的な HIV-1 増殖は、5100 HIV-1 RNA コピーの臨界増殖閾値を超える初期ウイルス バースト サイズに依存することが示されています。 ここで我々は、指数関数的複製閾値以下のウイルス動態を特徴付ける超高感度 HIV-1 Gag p24 濃度と HIV-1 RNA コピー数との関連を示します。 シングルゲノム配列決定 (SGS) により、複数の同一の HIV-1 配列の存在が明らかになり、VOA の早期に指数関数的増殖の閾値以下で低レベルの複製が発生していることが示されました。 しかし、SGS はさらに、指数関数的な増殖を確立することができなかった超高感度の方法によって検出可能な、関連する多様な HIV 変異株を明らかにしました。 全体として、我々のデータは、培養中で指数関数的増殖を確立するのに必要な閾値を下回って発生するウイルス増殖は、再活性化されたHIVの複製能力を妨げるものではなく、HIV-1 p24の超高感度検出は、これまで定量化できなかった変異体を検出する方法を提供する可能性があることを示唆している。 これらのデータは、潜在的なウイルス量と HIV-1 治癒を目的とした治療介入の有効性を測定するための多方面からのアプローチにおける Simoa プラットフォームの使用を強く裏付けています。
抗レトロウイルス併用療法(cART)は、ヒト免疫不全ウイルス 1 型(HIV-1)の複製を制御し、病気の進行を大幅に遅らせますが、再燃する可能性のある長命のウイルス保有者が存在するため、処方された cART レジメンを生涯遵守する必要があります。治療が中断された場合1、2、3、4、5。 このリザーバーは感染の非常に初期に確立され、体内のリンパ組織全体に広く分散しており、依然として HIV-1 根絶に対する主要な障壁となっています 6。 休止期 CD4+ T 細胞は、潜在的な HIV 保有者の一部を保持していることが示されている、よく特徴付けられた細胞タイプです。 現在、多くの臨床試験が、これらの細胞のクリアランスに対する潜伏期逆転剤と抗 HIV 免疫拡大の効果を調査しています 7,8。
HIV-1 治療戦略の有効性を判断するには、潜在的に感染している細胞の頻度を正確に測定することが非常に重要です。 従来の PCR ベースのアッセイは、ex vivo 増殖法よりも高いアッセイ処理速度と感度を提供しますが、個体内でリバウンドする可能性のあるコンピテント リザーバーとそうでないリザーバーを区別することはできません 9、10、11。 最近、多くのグループが、ウイルス ゲノムの保存された部分よりも複数のプライマーとプローブを使用した無傷のプロウイルス ゲノムの検出の向上を報告しました 12,13。 しかし、完全なプロウイルスの増幅成功を制限する配列多型のせいで、この方法で増幅されたウイルスの 30 ~ 40% はまだ欠陥がある可能性があると推定されています 13、14、15。 対極にあるのは、複製能力のあるウイルスの検出のゴールドスタンダードと考えられている定量的ウイルス増殖アッセイ (QVOA) などの培養ベースの方法です。 しかし、QVOA の調査により、1 回の細胞刺激後にプロウイルスの一部が誘導されずに残るため、QVOA が潜在リザーバーの実際のサイズを過小評価していることが明らかになりました 11,16。
0.0722, conventional ELISA p > 0.0893). Taken together, these results suggest that digital ELISA effectively shortens the duration of QVOA culturing, resulting in reduction of efforts and costs while measuring latent HIV-1 reservoirs, which is of major importance to the HIV-1 cure agenda42,43./p> 15 year follow-up sample collected from a study participant of an RV130/514 clinical trial (NCT01013415) through conventional ELISA did not yield a reservoir measurement, however, digital ELISA identified HIV-1 p24 above the LOD in 7 out of 16 supernatants (Fig. 1S). All the measurements collected by digital ELISA exhibited HIV-1 p24 molecule concentrations below the critical threshold of genome copy equivalents required to establish exponential replication, suggesting either inadequate levels of virus reactivation or insufficient levels of replication inside the wells, consequently leading to failure to launch ex vivo exponential outgrowth in culture. Ultimately, the QVOA coupled with digital ELISA produced a reservoir measurement (0.778 p24-producing cells per million resting CD4 T cells with a 95% confidence interval from 0.365 to 1.665) whereas conventional ELISA and integrated HIV-1 DNA assay did not return a quantifiable measurement (Fig. 1S)./p> 0.98), confirmation of the standard curve, quality controls, sample CVs (< 20%), ambient temperature and humidity monitoring during the run, adjustment of assay definition concentrations to that of the kit lot, in addition to assessment of any relevant errors during the analysis (e.g. too much fluorescence scored as positive and fluorescence below the standard curve scored as negative) as per manufacturer’s instructions. Four-parameter logistic (4PL) regression fitting, 1/y2 weighted, was used to estimate the concentration of p24 in the culture supernatants using the manufacturer’s software analysis. Wells were considered positive for the presence of p24 if the concentration was above 0.0515 pg/mL./p>